Nếu công ty trực tiếp ký hợp đồng lao động và chi trả lương cho người lao động làm việc tại chi nhánh thì công ty có trách nhiệm khấu trừ, kê khai nộp thuế TNCN tập trung tại trụ sở chính. Trường hợp chi nhánh công ty trực tiếp trả lương cho người lao động thì chi nhánh phải thực hiện đăng ký thuế, khấu trừ, kê khai nộp thuế TNCN cho cơ quan thuế trực tiếp quản lý chi nhánh
